Počátky muzea v Hradci Králové spadají do roku 1880, kdy bylo založeno městské muzeum.
Dnes je Muzeum východních Čech v Hradci Králové jedním z největších regionálních vlastivědných muzeí ve východních Čechách. Od roku 2001 je příspěvkovou organizací zřizovanou Královéhradeckým krajem.
Plní funkci muzea ve smyslu příslušných ustanovení zákona č. 122/2000 Sb., o ochraně sbíre muzejní povahy a o změně některých dalších zákonů, a je zřízeno za účelem získávat, shromažďovat, trvale uchovávat, evidovat, odborně zpracovávat a zpřístupňovat veřejnosti sbírky muzejní povahy.
V současné době má muzeum v archeologických, přírodovědeckých a historických sbírkách přibližně jeden milion sbírkových předmětů.
Vedle dlouhodobých expozic muzeum pořádá ročně přibližně 10 až 15 tématických výstav a řadu dalších kulturních a společenských akcí, vydává periodické i neperiodické publikace a organizuje odborné konference a semináře.
Od roku 1993 je součástí muzea též Památník bitvy 1866 na Chlumu.
Muzeum je zapsáno v obchodním rejstříku Krajského soudu v Hradci Králové, oddíl Pr, vložka 758. Identifikační číslo organizace je 00088382.